স্বাস্থ্য অধিদপ্তরের সকল কার্যক্রম জাতীয়, বিভাগীয়, জেলা, উপজেলা, ইউনিয়ন, ওয়ার্ড ও মাঠ পর্যায়ে বিস্তৃত। জাতীয় পর্যায়ে জনস্বাস্থ্য প্রতিষ্ঠান, স্নাতকোত্তর চিকিৎসা প্রতিষ্ঠান এবং বিশেষায়িত স্বাস্থ্য প্রতিষ্ঠান ও হাসপাতাল সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। বিভাগীয় পর্যায়ে মেডিকেল কলেজ ও হাসপাতাল, জেনারেল হাসপাতাল, সংক্রামক হাসপাতাল এবং হেল্থ টেকনোলজি প্রতিষ্ঠান সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। জেলা পর্যায়ে সদর হাসপাতাল, জেনারেল হাসপাতাল, মেডিকেল কলেজ ও হাসপাতাল, সংক্রামক হাসপাতাল, বক্ষব্যাধি ক্লিনিক এবং মেডিকেল ট্রেনিং স্কুল সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। উপজেলা পর্যায়ে উপজেলা স্বাস্থ্য কমপ্লেক্স ও টিবি ক্লিনিকসমূহ সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। ওয়ার্ড মাঠ পর্যায়ে কমিউনিটি ক্লিনিকমূহের মাধ্যমে সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করা হয়ে থাকে।
জেলা পর্যায়ে সদর হাসপাতাল, জেনারেল হাসপাতাল, মেডিকেল কলেজ ও হাসপাতাল, সংক্রামক ব্যাধি হাসপাতাল, বক্ষব্যাধি ক্লিনিক এবং মেডিকেল ট্রেনিং স্কুল সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। উপজেলা পর্যায়ে উপজেলা স্বাস্থ্য কমপ্লেক্স ও বক্ষব্যাধি ক্লিনিকসমূহ সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করে। ওয়ার্ড অথবা মাঠপর্যায়ে কমিউনিটি ক্লিনিকসমূহের মাধ্যমে সকল চিকিৎসা সেবা প্রদান করা হয়ে থাকে।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস